अपने ओवन को मध्यम तापमान पर, आमतौर पर लगभग 350°F (175°C) पर पहले से गर्म करके शुरुआत करें। जब ओवन पहले से गरम हो रहा हो, तब शिमला मिर्च को स्टफिंग के लिए तैयार कर लीजिये. सख्त और रंगीन शिमला मिर्च चुनें और ऊपर से सावधानी से काट लें, अंदर से बीज और झिल्ली हटा दें। एक मिक्सिंग बाउल में स्टफिंग मिश्रण तैयार करें। पके हुए क्विनोआ या ब्राउन चावल को काली बीन्स, मकई के दाने, कटे हुए टमाटर, कटा हरा धनिया और भीगे हुए चिया बीज के एक हिस्से के साथ मिलाएं। अतिरिक्त स्वाद के लिए मिश्रण में अपनी पसंद के मसाले, जैसे जीरा, लाल शिमला मिर्च, मिर्च पाउडर, नमक और काली मिर्च डालें।
एक बार जब स्टफिंग अच्छी तरह से मिश्रित हो जाए, तो प्रत्येक खोखली बेल मिर्च को क्विनोआ या चावल के मिश्रण से भरें, इसे कसकर पैक करें ताकि यह सुनिश्चित हो सके कि वे अच्छी तरह से भरी हुई हैं। शिमला मिर्च को बेकिंग डिश में रखें, पन्नी से ढकें और पहले से गरम ओवन में रखें। भरवां शिमला मिर्च को लगभग 30-40 मिनट तक बेक करें। एक बार हो जाने पर, फ़ॉइल हटा दें और परोसें।